wsunccake的隨手記事

compile ruby source code:
Linux:~ # wget http://cache.ruby-lang.org/pub/ruby/2.1/ruby-2.1.3.tar.bz2
Linux:~ # tar jxf ruby-2.1.3.tar.bz2
Linux:~ # cd ruby-2.1.3/
Linux:~/ruby-2.1.3 # ./configure --prefix=/usr/local/ruby
Linux:~/ruby-2.1.3 # make
Linux:~/ruby-2.1.3 # make install
注意, 安裝前先確認已有zlib-devel, opens-devel, readline. 沒有也可以安裝, 只是之後 gem 沒辦法使用

BASH 有 Shell shock (可參考, Bash Shell 漏洞威脅不小於 Heartbleed！Unix-Like 作業系統請儘速更新)
# 測試方法
Linux:~ $ env x='() { :;}; echo vulnerable' bash -c "echo this is a test"
# 有漏洞時顯示結果
vulnerable
this is a test
# 以修補後顯示結果
bash: warning: x: ignoring function definition attempt
bash: error importing function definition for `x'
this is a test

RobotFramework(有時候簡稱robot, RF), 是一款Python編寫的automation framework(自動化測試軟體框). 具備良好的可擴展性, 支持keyword-driven(關鍵字驅動), 可同時測試多種類型的客戶端或者介面, 進行分布式測試執行. 主要用於重複性的回歸測試以及Acceptance Test-Driven Development(驗收測試驅動開發, ATDD), 同時還支持Behavior-Driven Development(行為驅動開發, BDD).
RF除了可以在Python上執行, 也可用Jypthon(JVM)或IronPython(.Net)執行, 在此主要介紹還是使用Python的方式.
RIDE則是RF常用的IDE一種, RIDE主要使用wxPython開發出來, 所以需安裝wxPython.
OS: Ubuntu 12.04.1 LTS (x86_64)
# install easy_install and pip module
Ubuntu:~ $ sudo apt-get install python-setuptools
Ubuntu:~ $ sudo apt-get install python pip
# install robotframework
Ubuntu:~ $ sudo pip install robotframework
# run robotframework
Ubuntu:~ $ sudo apt-get install git
Ubuntu:~ $ git clone https://bitbucket.org/robotframework/robotdemo.git
Ubuntu:~ $ cd robotdemo
Ubuntu:~/robotdemo $ pybot keyword_driven.txt 
# install ride
Ubuntu:~ $ sudo apt-get install python-wxgtk2.8 python-wxtools wx2.8-i18n libwxgtk2.8-dev libgtk2.0-dev
Ubuntu:~ $ pip install robotframework-ride
# run ride
Ubuntu:~ $ ride.py
ref:
ROBOTFRAMEWORK
Robot Framework User Guide Version 2.8.5
RobotFrameWork（一）robotframework（python版）及Ride在ubuntu下安装
robotframework
robotframework-ride

因為 Mac 的 Mac OS X 升級到 10.9 之後, 原本給 Cisco Packet Tracer for MAC 就沒辦法使用.
在網路上查到, 原來是 Mac OS X 在 10.7 之後, 就差很多. 目前看的方式, 使用 Wineskin(Mac下的Windows模擬器)配合Cisco Packet Tracer(這是for windows)就可以使用了
ref:
how to Packet Tracer 6.0.1 in Mac
Wineskin 載點
Cisco Packet Tracer for Windows 載點

PTSIM (Particle Therapy System simulation framework) 是利用Geant4的粒子束治療模擬程式/框架
在安裝之前, 需要g++ compiler, Geant4 和 Root. 若要使用平行計算, 還需另外安裝MPI 及 G4MPI
Geant4:
Linux:~ # wget http://geant4.web.cern.ch/geant4/support/source/geant4.9.6.p02.tar.gz
Linux:~ # tar zxf geant4.9.6.p02.tar.gz
Linux:~ # mkdir geant4-build
Linux:~ # cd geant4-build
Linux:geant4-build # cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/geant4 ../geant4.9.6.p02
Linux:geant4-build # make
Linux:geant4-build # make install
到http://geant4.cern.ch/support/source下載所有Data file, 並解壓縮到/usr/local/share/Geant4-9.6.2/data目錄下
G4MPI:
G4MPI已經收入在Geant4裡, 只要先安裝好Geant4就可以繼續安裝G4MPI
Linux:~ # mkdir g4mpi-build
Linux:~ # cd g4mpi-build
Linux:g4mpi-build # cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_CXX_COMPILER=mpic++ -DGeant4_DIR=/usr/local/geant4/lib64/Geant4-9.6.2 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/geant4 ../geant4.9.6.p02/examples/extended/parallel/MPI/source
Linux:g4mpi-build # make
Linux:g4mpi-build # make install
Root:
Linux:~ # wget ftp://root.cern.ch/root/root_v5.34.14.source.tar.gz
Linux:~ # tar zxf root_v5.34.14.source.tar.gz
Linux:~ # cd root
Linux:root # ./configure linuxx8664gcc --prefix=/usr/local/root --etcdir=/usr/local/root/etc
Linux:root # make
Linux:root # make install
PTSim:
到http://wiki.kek.jp/pages/viewpage.action?pageId=5343876下載
Linux:~ # tar zxf PTSproject-20131125.tar.gz
Linux:~ # cd PTSproject
Linux:PTSproject # ./buildToolkitIAEA.sh -DGeant4_DIR=../geant4/lib64/Geant4-9.6.2
Linux:PTSproject # ./buildDynamicIAEA.sh -DGeant4_DIR=../geant4/lib64/Geant4-9.6.2

import unittest # 載入unittest
class Person: # 要測試的class
    def __init__(self, name):
        self.name = name
        self.age = 10
    def getName(self):
        return self.name
    def setAge(self, age):
        self.age = age
class TestPerson(unittest.TestCase):
    def setUp(self): # 每個測試初始化
        print 'init',
        self.p = Person('John')
    def test_getName(self): #要測試的功能, 名稱需test開頭
        print 'test getNme',
        self.assertEqual(self.p.getName(), 'John' )
    def test_setAge(self):
        print 'test setAge',
        self.assertEqual(self.p.age, 10 )
        self.p.setAge(18)
        self.assertNotEqual(self.p.age, 10 )
    def tearDown(self): # 每個測試結束
        print 'final'

Root是CERN在HEP(High Energy Physics)使用的c++ 數值函式庫, 主要是處理大量資用. 可到 http://root.cern.ch/drupal/content/downloading-root 下載
System Info:
OS: Scientific Linux CERN SLC release 6.4
Compiler: g++ 4.4.7
SLC:~ $ wget ftp://root.cern.ch/root/root_v5.34.14.source.tar.gz
SLC:~ $ tar zxf root_v5.34.14.source.tar.gz
SLC:~ $ cd root
SLC:~ $ ./configure --prefix=~/rootp --etcdir=~/rootp/etc --disable-x11 # --prefix: 程式安裝路徑, --etcdir: 設定檔安裝路徑(預設為/etc/root, 因為不是root安裝, 所以要改), --disable-x11 不編譯x11相關套件
SLC:~ $ make && make install

Compiler: Intel Fortran & Intel C
MPI: OpenMPI
Package: polyrate2010-A.tar.gz

GromacsGUI(又稱GroGUI), 是Gromacs的圖形界面程式, 方便使用者做Gromacs設定. 使用C++/QT函式開發, 所以在編譯時要安裝g++和qt函式庫, 若需要有分析功能, 還需另外裝qwt函式庫. 在SLES 12安裝不需修改設定檔, 但在RedHat系列要做些小改變. 
下載網址 http://resal.wordpress.com/gromacs-gui
CentOS:~ # tar zxf 47665-grogui052.tar.gz
CentOS:~ # cd grogui052/gui_withplotting #系統需有安裝qwt

step 1. 使用rails script建立project
os:~ $ rails new demo #建立新project，名稱為demo
os:~ $ cd demo
os:~/demo $ rails g controller Say hello #建立controller和view